يصنف المرض إما كالتهاب الإحليل بالمكورات البنية والذي تسببه النيسرية البنية أو كالتهاب الإحليل بغير المكورات البنية والذي تسببه غالباً المتدثرة الحثرية ويسمى أحيانا التهاب الإحليل غير المحدد. وقد تؤدي إليه على حد سواء أسباب معدية أو غير معدية.
أسباب أخرى:
فيروسات غدانية
الإشريكية القولونية المسببة للأمراض البولية.
هربس بسيط
ميكوبلازما التناسلية
التهاب المفاصل الارتكاسي
المشعرات